Articulos | Acuacultura


Microbiomas II
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Poblaciones bacterianas en camarones sanos y con el síndrome de las heces blancas (WFS)

Composición general de la comunidad bacteriana

Los productos de PCR de las muestras se combinaron por igual y luego se secuenciaron utilizando la plataforma Illumina Hiseq2500.
Las secuencias se agruparon en unidades taxonómicas operativas (OTU) 97% de similitud
Para determinar las relaciones filogenéticas de las diferentes OTU y las especies dominantes en las diferentes muestras, se realizó una alineación de secuencia múltiple con MUSCLE.
El i´ndice de Shannon y los análisis de correlación de Spearman se usaron para probar las correlaciones entre comunidades microbianas grupos sanos y WFS

Composicio´n general de la comunidad bacteriana

34 phyla: Proteobacteria (57%), Tenericutes (23%), Firmicutes (9%) y Bacteroidetes (6.6%)
- Nivel de genero: Candidatus Bacillo Plasma, Photobacterium, Vibrio, Paracoccus
Lactobacillus, Ruegeria, Haloferula, Shewanella, Marinicella, and Helicobacter
??- Se compartieron 1395 OTUs (sanos y enfermos)

Composicio´n de OTU en camarones con WFS

Phascolarctobacterium, Blautia
- Clostridium, Subdoligranulum y Bacteroides
- Candidatus Bacilloplasma, Phascolarctobacterium
- Ruminococcus

Composicio´n de OTU en camarones sanos

Paracoccus,Lactococcus